Genovis的PNGase F 是一種糖酰胺酶，可水解多肽天冬酰胺與所有哺乳動物天冬酰胺連接復(fù)合物、雜交體或高甘露糖寡糖的內(nèi)層 GlcNAc 之間的酰胺鍵。 在反應(yīng)過程中，從中去除聚糖的天冬酰胺殘基被脫酰胺為天冬氨酸。釋放的低聚糖完好無損，可用于進(jìn)一步分析。N-糖的去除被用于MS分析的樣品制備，以降低蛋白質(zhì)的異質(zhì)性，使游離的糖分析成為可能，并研究N-糖的功能作用。 該酶在大腸桿菌中表達(dá)，該重組基因來源于伊麗莎白金氏腦膜敗血癥。 評價抗體片段對完整蛋白聚集的影響。 IgG1 mAb1和mAb2在Biogen生產(chǎn)。 mAb1被糖基化，主要的糖型是具有0和1半乳糖的he心聚焦雙觸角聚糖(FA2和FA2G1); mAb2被糖基化。因此，其水解需要底物蛋白以與酶活性相容的方式變性。上海瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis
水解O-聚糖的酶不會從變性中獲益，這就是為什么OmniGLYZOR色譜柱只能在天然條件下使用的原因。 OmniGLYZOR 試劑盒 Microspin 以含有足夠材料的試劑盒形式提供，可使5 × 50-100 μg 或 10 × 50-100 μg 糖蛋白去糖酸化。N-和O-連接聚糖的快速高效；與LC-MS兼容；完全去除聚糖，改進(jìn)基礎(chǔ)蛋白的分析；固定形式可提高酶與底物的比率，從而實現(xiàn)快速去糖基化。 IgdE酶(FabALACTICA?)和PNGaseF酶分別購自Genovis(馬薩諸塞州，美國)。用于水解糖蛋白上N-聚糖的凍干酶。Genovis的PNGase F 凍干劑以凍干粉的形式提供，裝在 1000 或 5 x 1000 單位小瓶中，分別用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。重慶用于自動化系統(tǒng)的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物藥物開發(fā)并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亞基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分別分析。
在Genovis的PNGaseF去除N-聚糖并用SialEXO和GalactEXO截斷O-聚糖后，在質(zhì)譜圖中觀察到幾個與GalNAcs相關(guān)的峰。為了去除剩余的GalNAc殘基，應(yīng)用GalNAcEXO酶。用GalNAcEXO處理后觀察到的單個蛋白峰顯示完全去除剩余的GalNAcs。?GalNAcEXO在生理緩沖液和中性pH值中具有活性，使其與大多數(shù)樣品相容。此外，GalNAcEXO的活性不依賴于任何可能影響LC-MS分析的輔因子，如BSA。根據(jù)底物的性質(zhì)，糖蛋白的GalNAcEXO反應(yīng)在2小時內(nèi)完成，而更復(fù)雜的樣品可能需要孵育過夜。Genovis的GalNAcEXO也可固定在離心柱中，以便快速方便地處理樣品，在制備過程中不會殘留酶。
GlycOCATCH設(shè)計用于特異性結(jié)合粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽。親和樹脂基于無活性的Genovis的OpeRATOR酶，該酶經(jīng)過工程設(shè)計，可以高親和力結(jié)合O-糖基化蛋白和肽。 結(jié)合在pH 5-8的生理緩沖液中進(jìn)行。由于GlycOCATCH樹脂和O-糖蛋白/肽之間的強(qiáng)相互作用，可以用8M尿素進(jìn)行洗脫?；蛘撸梢允褂没钚設(shè)peRATOR酶進(jìn)行洗脫，該酶消化O-聚糖位點的N末端結(jié)合的O-糖蛋白。在后一種情況下，肽在天然條件下回收。OpeRATOR 凍干酶包含在購買中。由于 O-糖蛋白上的旋亞氨酸化 O-聚糖與樹脂結(jié)合效率更高，因此唾液酸酶混合物 SialEXO 凍干也包含在購買中。用于糖蛋白去唾液酸化的凍干酶混合物SialEXO 凍干劑以凍干粉的形式提供，裝在 2000 個單位的小瓶中。
我們展示了使用兩種蛋白作為底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一種 Fc 融合蛋白，含有 TNFα 受體的胞外結(jié)構(gòu)域。該結(jié)構(gòu)域用 2 個 N-糖和 8-11 個 1 個具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修飾。在 37°C 下將這種重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小時，可完全去除所有 N-和 O-糖，如中級 LC-MS 分析所示。促紅xibao生成素 （EPO） 是一種攜帶 3 個 N-聚糖和 1 個he心 1 個 O-聚糖的小蛋白質(zhì)，其總質(zhì)量的近 40% 由聚糖組成。O-連接聚糖通常存在于蛋白質(zhì)的暴露位置，因為它們在蛋白質(zhì)折疊發(fā)生后附著。只有負(fù)責(zé)其合成的糖基轉(zhuǎn)移酶才能接觸到這些暴露的位點。在天然條件下使用OmniGLYZOR Microspin色譜柱，可在3小時內(nèi)有效去除C1 抑制劑O-聚糖。北京PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis
GalNAcEXO酶是可降低樣品異質(zhì)性，用于分析攜帶α連接的 GalNAc 殘基作為未成熟截短he心 1 的復(fù)雜 O-糖蛋白。上海瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis
OglyZOR 來源于口腔鏈球菌，在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有 His 標(biāo)簽，分子量為 227 kDa。SialEXO來源于Akkermansia muciniphila，在大腸桿菌中表達(dá)。SialEXO酶含有His標(biāo)簽，組分的分子量分別為42 kDa和66 kDa。1.高效O-糖苷酶；2. 降低樣品異質(zhì)性，揭示潛在的關(guān)鍵蛋白質(zhì)修飾；3. 完全、穩(wěn)健地去除 O-糖he心 1 二糖。Genovis的凍干酶，用于水解糖蛋白上的he心1 O-聚糖。OglyZOR 凍干劑以凍干粉的形式提供，裝在 2000 個單位的小瓶中，用于在 2 mg 糖蛋白上水解he心 1 O-聚糖。它需要去除唾液酸助劑才能發(fā)揮作用，因此與2000單位的SialEXO凍干一起提供。上海瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis
糖蛋白性能測試：O-聚糖的巖藻糖基化參與功能上重要的聚糖表位的合成，例如血型抗原和劉易斯結(jié)構(gòu)。分析用...
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