浙江FabRICATORIdeS蛋白酶抗體酶切

Blinatumomab（一種對 CD19 和 T 細胞標志物 CD3 具有特異性的 BiTE 分子）的研究級生物仿制藥在室溫下用固定化過夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通過LC-MS對消解樣品的直接分析表明，所有三個連接子區(qū)域均被消解，α-CD3 VL和VH鏈洗脫為一個色譜峰，α-CD19 VH和VL鏈作為單獨的峰洗脫。來自連接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 結構域的小峰顯示該短連接子未完全消化，表明 GlySERIAS 對短連接子的活性較低。與完整的蛋白質(zhì)分析相比，四個結構域的分離提供了具有單同位素分辨率的高質(zhì)量光譜?？梢杂^察到每個結構域的幾個不同變體，剩余的連接子殘基數(shù)量不同。在色譜分離過程中，α-CD3 VH結構域無法從α-CD19 VH結構域完全基線分離，導致在相關質(zhì)譜中觀察到一些共洗脫。四個結構域的分離產(chǎn)生了有關在完整蛋白質(zhì)水平上鑒定的蛋白質(zhì)修飾位置的信息。例如，在完整水平上鑒定的 37 Da 的蛋白質(zhì)修飾被分配給 α-CD3 VH 鏈。此外，240Da 和 320da 的兩個修飾分別被分配給 α-CD3 VL 結構域。后者還含有一個帶有五六個組氨酸殘基的 His 標簽。這些數(shù)據(jù)證明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 對包含多個柔性連接子蛋白進行質(zhì)量控制的中級工作流程的強大功能。IgASAP Sub1+2 可消化分泌物和血清 IgA。浙江FabRICATORIdeS蛋白酶抗體酶切

對于攜帶突變鉸鏈的 Fc 融合蛋白或抗體來說，F(xiàn)ab 和 Fc 片段的生成可能具有挑戰(zhàn)性。Genovis的GingisKHAN酶在鉸鏈上方一個可觸及的賴氨酸位點消化人IgG1，在足夠溫和的還原條件下保留鏈內(nèi)和鏈間二硫鍵，從而產(chǎn)生完整的Fab和Fc片段。對于融合蛋白，消化通常在鉸鏈上方獲得，但融合伴侶的結構和氨基酸序列可能導致其他暴露的消化位點。如果去除保守的 Fc N-聚糖，F(xiàn)c 中的第二個切割位點也可能被GingisKHAN酶切。將精選的單克隆人 IgG1 抗體和 Fc 融合蛋白與 GingisKHAN 在 37°C 下孵育 1 小時，并通過 HPLC 進行分析。河南IgGZEROIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶可用于研究特定Fc區(qū)域的質(zhì)量屬性，有助于研究GS連接子的修飾。

為了讓所有實驗室都能同時快速自動消化多種抗體，Genovis的FabRICATORMagIC的設計具有靈活性，適用于一系列自動化平臺。我們在ThermoScientific?KingFisher?純化系統(tǒng)上優(yōu)化了FabRICATORMagIC的工作流程，但它可以轉移到其他自動化平臺，如果沒有自動化，在振動臺上也能同樣出色地工作。消解后，將含有處理樣品的深孔板直接轉移到LC-MS的自動進樣器中進行快速色譜分析，或轉移到其他分析方法進行分析。FabRICATORMagIC與在消解緩沖液中添加0.05%聚山梨醇酯20兼容，以極大限度地減少自動化系統(tǒng)中可能發(fā)生的純粹壓力。使用KingFisher儀器處理樣品時，樣品制備非常簡單。將樣品、樹脂和緩沖液移液到指定的孔或板中，然后將板放入儀器中。設計用于FabRICATORMagIC的BindIt?協(xié)議將控制每個步驟的孵育溫度和時間。

不同于IdeS，Genovis的FabDELLO 是一種蛋白酶，可在鉸鏈上方的單個位點消化人 IgG1，在兩小時內(nèi)產(chǎn)生完整的 Fab 和 Fc 片段，無需還原條件。該酶對具有突變鉸鏈區(qū)域的抗體（如 LALA 突變）具有活性，并啟用中級 LC-MS 來表征具有突變鉸鏈的抗體的關鍵質(zhì)量屬性。FabDELLO 在鉸鏈上方的單個位點消化人 IgG1 （...KSCDK / THTCPPCP...），生成完整的 Fab 和 Fc 片段。FabDELLO 是一種賴氨酸特異性蛋白酶。單個消化位點是人 IgG1 的三維結構的結果，使這種賴氨酸暴露于酶中。如果去除N-聚糖，則Fc上暴露的賴氨酸處可能會出現(xiàn)額外的消化位點。FabDELLO在天然條件下具有活性，需要鈣離子的存在。在37°C和pH 7-8.5下獲得良好活性。FabDELLO 是從 Bdellovibrio 細菌克隆而來的，并在大腸桿菌中表達。該酶含有 His 標簽，分子量為 32 kDa。FabRICATOR MagIC在mAb中級分析功能強大，可精確定位特定的修飾。

蛋白酶用于生成肽，用于質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)。這些應用包括蛋白質(zhì)組學和生物制藥的深度表征。由于遺漏了切割和樣品制備誘導的偽影，傳統(tǒng)的蛋白酶并不總是理想的，因此需要具有不同特異性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一種精氨酸特異性蛋白酶，可將蛋白質(zhì) C 末端消化為精氨酸殘基。與胰蛋白酶肽相比，所得肽更長，并可能導致序列覆蓋率增加。質(zhì)譜分析中蛋白酶的特異性對于獲得高質(zhì)量的數(shù)據(jù)集和避免復雜的數(shù)據(jù)解釋至關重要。作為模型底物，使用胰島素氧化β鏈來比較 GingisREX 和 ArgC 的酶特異性。胰島素氧化β鏈含有一個精氨酸和一個賴氨酸殘基。在RP-HPLC和質(zhì)譜法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在賴氨酸殘基上沒有酶活性或其他額外活性，即使在長時間孵育過夜后，酶與底物的比例也很高（1：5）。然而，ArgC在精氨酸殘基上顯示出主要活性，但在賴氨酸殘基上也可以看到酶消化。在酶與底物的比例為 1：20 和過夜孵育下，證明了 ArgC 的額外非特異性活性。在相同條件下，GingisREX未檢測到這種情況。數(shù)據(jù)證實了GingisREX精氨酸殘基的特異性活性，并顯示使用Arg-C在賴氨酸和其他殘基處的非特異性消化。發(fā)現(xiàn)GingisREX精氨酸殘基的特異性，Arg-C在賴氨酸和其他殘基的非特異性。上海GlySERIASIdeS蛋白酶抗體酶切

為了降低度拉糖肽復雜性，使用GlycINATOR Lyophilized去除Fc聚糖，并用DTT還原鏈間二硫鍵。浙江FabRICATORIdeS蛋白酶抗體酶切

與IdeS不同。Genovis的IgASAPSub1是一種IgA1特異性酶，可在鉸鏈上方的一個特定位點消化人IgA1，產(chǎn)生完整且均質(zhì)的Fab和Fc片段。IgASAPSub1可水解分泌物和血清IgA1。消化在1小時內(nèi)完成，并且由于酶的特異性，如果孵育時間延長，則不存在過度消化的風險。該酶在pH值6.5至8.0下具有活性，不需要還原條件或輔助因子即可發(fā)揮活性?；钚允窃?7°C下，但也可以在室溫下使用增加孵育時間進行消化。IgASAPSub1是從口腔鏈球菌克隆而來的，并在大腸桿菌中表達。該酶含有His標簽，分子量為148kDa。IgASAPSub1凍干劑以凍干粉的形式提供，裝在1000個單位的小瓶中，用于消化1mgIgA1。浙江FabRICATORIdeS蛋白酶抗體酶切