甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌是土壤里的“碳鏈煉金師”。它以甲醇、甲胺等一碳化合物為主食,卻能把這些常被忽視的小分子變成高值產物。菌體在含甲醇的培養(yǎng)基中迅速萌發(fā),分泌甲醇脫氫酶,將有毒的甲醇先氧化為甲醛,再經RuMP循環(huán)固定為果糖-6-磷酸,既獲得能量,又合成自身所需碳骨架。整套反應在pH 7、30℃下效率比較高,甲醇轉化率可達理論值的92%,遠高于化學催化。更難得的是,它同時是一株“生物兵工廠”。在利用甲醇的同時,甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌能合成表面活性素、泛革素等脂肽,對黃瓜枯萎、辣椒疫霉、番茄青枯的抑菌帶寬達25-30毫米;其揮發(fā)性的3-甲基-1-丁醇、2-甲基吡嗪可誘導植物系統(tǒng)抗性,使棉花黃萎病指下降40%。田間試驗表明,每畝用200克菌粉滴灌,玉米根際甲醇天然濃度降低60%,植株葉綠素提高1.5個SPAD單位,產量增加8%,且農藥使用量減少三成。工業(yè)端,科研團隊把聚-γ-谷氨酸合成酶基因導入甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌,使其在消耗甲醇的同時產出高黏度γ-PGA,可作為保水劑、絮凝劑或醫(yī)用敷料;5噸罐分批發(fā)酵,γ-PGA產量達25 g/L,成本比傳統(tǒng)谷氨酸發(fā)酵低20%。此外,其芽孢可耐沸水煮15分鐘、紫外照射兩小時,噴霧干燥存活率超過90%,為大規(guī)模制劑化提供了便利。奇異水螺菌還被用于生物防治,其產生的物質可以抑制一些植物病原菌的生長,從而減少農藥的使用。大洋考克氏菌
MB培養(yǎng)基基礎(Marine Broth Base)是一種專為海洋細菌設計的富營養(yǎng)液體培養(yǎng)基,由蛋白胨、酵母粉及多種無機鹽組成,pH 7.2–7.6,滲透壓與海水相當。配方中氯化鈉濃度約2–3%,并補充鎂、鉀、鈣等海水中主要離子,可瞬時啟動依賴高鹽環(huán)境的嗜鹽菌與耐鹽菌,縮短延滯期。實驗室常規(guī)做法是將培養(yǎng)基干粉溶解于蒸餾水后,補加陳海水或人工海鹽,即可恢復接近自然海水的離子譜,使挑剔的海洋放線菌、弧菌、假單胞菌等迅速進入對數(shù)生長,用于后續(xù)分離、保藏或活性物質篩選。由于海洋微生物常產色素、抗生物質及胞外多糖,MB培養(yǎng)基的高營養(yǎng)特性可充分展現(xiàn)這些次級代謝潛能:弧菌在28℃、180 r/min振蕩培養(yǎng)12小時,菌濃即可達10? CFU/mL,菌液呈乳白或淡粉;某些Planococcus則分泌墨藍色素,使整瓶培養(yǎng)液變?yōu)榈逅{,成為天然色素研究的理想起點。若需固體培養(yǎng),只需補加1.5%瓊脂,即成MBA平板,可在表面涂布沉積物懸液,28℃培養(yǎng)2–3天,挑取形態(tài)各異的單菌落進行16S rDNA鑒定,流程簡潔高效。在質量控制方面,MB培養(yǎng)基需用人工海水或陳海水配制,切忌直接使用自來水,以免鈣鎂離子不足或氯殘留抑制菌體;滅菌后若出現(xiàn)沉淀,多為鎂鹽析出,可50℃水浴復溶,不影響使用。

克勞氏芽孢桿菌(Bacillus clausii)是芽孢桿菌屬中的“耐堿”,1915年由意大利克勞氏從堿性土壤中分離,菌體桿狀、周生鞭毛,可在 pH 8–10.5、鹽 0–12 % 的條件下旺盛生長,芽孢能耐受 100 ℃ 沸水 30 min,是研究極端堿適應的模式菌之一。一、耐堿機制基因組編碼多拷貝 Na?/H? 逆向轉運蛋白(nhaC、mnh)與碳酸酐酶,可將胞內多余 Na? 泵出并維持 pH 穩(wěn)態(tài);細胞壁肽聚糖富含 meso-二氨基庚二酸,膜脂分支化程度高,為高溫高堿酶的高效表達提供穩(wěn)定平臺。二、工業(yè)酶寶庫其耐堿蛋白酶在 pH 11、40 ℃ 仍保持 90 % 活性,已用于無磷洗滌劑,血漬、奶漬去污力提升 30 %;耐堿淀粉酶更適 pH 9、90 ℃,可在紡織退漿中省略中和步驟,節(jié)能 15 %;耐堿木聚糖酶用于紙漿漂白,氯用量減少 30 %,降低可吸附有機鹵化物(AOX)排放。三、農業(yè)與環(huán)境菌株 SIN 可產 IAA 15 mg·L?1 并溶磷 2.6 mg·L?1,使玉米根系增 28 %,吸磷量提 18 %;與秸稈復配堆肥,24 h 堆溫升至 65 ℃,纖維素降解率提高 30 %,堆肥周期縮短 6 d。耐堿特性使其在 pH 9 的蘇打鹽堿土中仍能定殖,水稻產量增加 10 %。
德氏乳桿菌德氏亞種(Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii)是乳酸菌家族中更早被分離命名的“元老”之一,1901年即進入科學視野。菌體短桿、無芽孢、不運動,專性發(fā)酵葡萄糖產乳酸,更適生長溫度42~45℃,可在pH 3.5的酸環(huán)境中存活,耐高溫卻畏冷,4℃即停止繁殖。基因組只1.8 Mb,代謝途徑精簡,卻擁有完整的乳酸脫氫酶與寡肽轉運系統(tǒng),使其在蛋白質豐富的基質中快速產酸,抑制菌。工業(yè)上,它是酸奶、瑞士奶酪與保加利亞傳統(tǒng)發(fā)酵乳的關鍵菌種,與嗜熱鏈球菌協(xié)同可將牛乳在3小時內酸化至pH 4.2,形成細膩凝乳與特征性乙醛風味;同時分泌胞外多糖,賦予產品順滑口感并延緩后酸化。近年研究還發(fā)現(xiàn),其表面蛋白SlpA能黏附腸道上皮,誘導IL-10分泌,緩解小鼠結腸炎;熱滅活菌體亦可通過啟動樹突細胞TLR2信號,增強腸道IgA應答,兼具益生與免疫調節(jié)潛力。隨著合成生物學興起,德氏乳桿菌德氏亞種被工程化改造為“活藥工廠”,可在腸道內持續(xù)釋放胰島素樣肽或白細胞介素,為糖尿病與炎癥性腸病提供新型微生態(tài)治療方案。功能層面,巴基斯坦賴氨酸芽孢桿菌表現(xiàn)出“促生-抗病-解決”三合一特性。

擴散芽孢桿菌(Bacillus diffusus)是芽孢桿菌屬里的“運動健將”。菌體桿狀、周生鞭毛,在瓊脂表面可形成迅速擴展的薄膜狀菌落,24 h內直徑達80 mm,故得名“diffusus”。其更適生長溫度30–37 ℃,pH 6–9,耐干燥、耐紫外,芽孢可存活十年以上,為制劑化提供質量特性。一、快速定殖菌株DSM 13271分泌大量胞外多糖,降低表面張力,使菌體在沙壤土中遷移速度提高3倍;與枯草芽孢桿菌復配,可形成“生物被膜”,優(yōu)先占據根際生態(tài)位,抑制病原菌入侵。二、廣譜抑菌擴散芽孢桿菌產生diffusin脂肽,對番茄青枯、辣椒疫霉、棉花黃萎等病原菌抑菌帶寬達28 mm;溫室試驗顯示,畝用200 g菌粉滴灌,黃瓜枯萎病指下降45 %,農藥用量減少三分之一。三、促生提質菌株IAA產量25 mg·L?1,溶磷2.9 mg·L?1,并產揮發(fā)性2,3-丁二醇,誘導玉米側根增30 %,吸磷量提20 %;新疆鹽堿地示范,冬小麥千粒重增1.5 g,產量提高8 %。四、工業(yè)酶潛力其耐堿蛋白酶在pH 10、50 ℃下活性比較高,已用于洗滌劑,低溫去污力提升25 %;胞外多糖乳化力強,可作為鉆井泥漿降濾失劑,耐鹽達12 %。其基因組已被測序,為分子生物學和生物技術研究提供了豐富的資源。蒼黃假棍狀桿菌
其IAA產量達118mg/L,明顯高于同屬菌株,可刺激小麥根長增加35%,干重提高28%。大洋考克氏菌
長賴氨酸芽孢桿菌(Lysinibacillus macroides)是2013年從鯉腸道中分離的新成員,因細胞呈長桿、鏈狀排列而得名。它能在1/2LB培養(yǎng)基上形成淺褐色、光滑、直徑約1mm的菌落,革蘭氏陽性,具周生鞭毛,可產卵圓形芽孢,耐pH6–9、鹽0–6%,更適溫度35–37℃,對干旱、高溫和膽汁鹽均有良好適應力。其“本領”在于三酶合一:吲哚乙酸(IAA)分泌量達18mg/L,可刺激小麥根長增加35%;ACC脫氨酶活性降低植物乙烯水平,緩解鹽脅迫;鐵載體與蛋白酶協(xié)同,可抑制番茄青枯、辣椒疫霉等病原菌,抑菌帶寬22–28mm。山東大棚試驗顯示,用長賴氨酸芽孢桿菌菌液灌根,番茄根結線蟲侵染率下降42%,果實Vc含量提高12%,產量增8.3%。工業(yè)端,菌株ZJB-17009的酯酶對N-苯乙酰-DL-氨基酸水解選擇性達99%,已被用于綠色合成L-氨基酸;另一株C1在白酒窖池可產己酸和乙酸乙酯,使基酒主體香提高30%,為“增香菌”提供新選擇。未來,借助合成生物學,長賴氨酸芽孢桿菌有望被植入耐鹽、產聚-γ-谷氨酸模塊,成為鹽堿地“一菌多效”的先鋒,讓貧瘠土地也飄出豐收香。大洋考克氏菌